Värikalvossa oleva väripigmentti määrää silmien värin. Sinisissä ja harmaissa pigmenttiä on vähän, ruskeissa paljon. Iiris ympäröi mustuaisaukkoa säädellen mustuaisen kokoa ( 1,5 -8 mm ). Mustuaisaukon koon säätely perustuu mustuaisen laajentaja- ja kurojalihaksen refleksitoimintaan ja vaikuttaa silmään tulevan valon määrään.